Клиника КАУ располагается на территории Кампуса КАУ по адресу: ул. Торайгырова, 27.

Отдельные здравпункты располагаются в зданиях АУК КАУ, Ассоциированной ЮНЕСКО Школы при КАУ и на территории Кампуса КазГАСА.